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本发明公开了一种干旱区通过人工漂种快速补充退化生态系统种源的方法，包括：采集待恢复区退化植物群落本土优势建群种物种的种子并检测种子活力，选取达标的种子备用；对待恢复区进行漫灌补水，激活土壤种子库，改善优势建群种物种的繁育生境；对待恢复区进行灌溉补水时通过水流顺水飘撒处理得到的待恢复区退化植物群落本土优势建群种物种的种子，令种子随水飘播以实现种源补充。本发明通过科学地选择待恢复区人工漂种补充种源的物种，并借助人工生态输水的契机，结合有控制的人工漫溢和小范围洪泛生境创造，进行人工漂种，可使干旱的待恢复区的草本植物和灌木物种增加，群落盖度和群落密度显著提高，对干旱区生态系统具有良好的改善效果。