Nature Communications|从海洋天然产物到抗流感新靶点:中国海洋大学李德海团队和王伟团队发现NS1抑制剂

2026-9-5 科技资讯
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近日,中国海洋大学医药学院、海洋药物教育部重点实验室李德海教授团队和王伟教授团队在新靶标抗流感药物研究领域取得重要进展。研究团队从海洋来源化合物中发现了一种具有良好抗甲型流感病毒活性的吲哚生物碱衍生物HDN2398,并系统揭示了其通过靶向流感病毒非结构蛋白1(NS1)、同时干预NS1多种关键功能发挥抗病毒作用的分子机制。

相关研究以“Identifying a broad-spectrum influenza inhibitor that blocks multiple functions of viral NS1 protein”为题发表于国际期刊Nature Communications。中国海洋大学为第一通讯单位,李德海教授、王伟教授为共同通讯作者,张洋副教授、研究生罗亚楠和盖文睿为共同第一作者。中国海洋大学研究生王堇宇、黄亮浩、王子涵、孙立山以及新西兰惠灵顿维多利亚大学Ferrier研究院焦婉婷研究员为文章的共同作者。

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流感威胁持续存在,新型抗病毒药物

仍然迫切需要

流感并不仅仅是一场普通的“重感冒”。甲型流感病毒(Influenza A virus,IAV)具有宿主范围广、传播速度快和持续变异等特点,既是季节性流感的重要病原,也曾多次引发全球性流感大流行。H1N1和H3N2等季节性流感病毒每年可造成约300万—500万例重症病例,并带来大量死亡病例。

目前,临床抗甲型流感药物的作用靶点主要集中于病毒M2离子通道、神经氨酸酶(NA)以及聚合酶酸性蛋白(PA),代表性药物包括金刚烷胺类、奥司他韦、扎那米韦、帕拉米韦以及巴洛沙韦等。然而,随着病毒持续进化以及药物选择压力增加,耐药性、毒副作用以及治疗选择有限等问题始终存在。寻找区别于现有药物的新靶点、新骨架和新机制,是抗流感药物研发的重要方向。问题由此而来:除了传统的NA、M2和PA,还能不能找到一个更加“关键”、能够同时影响病毒多个生物学过程的新靶点?研究团队将目光投向了流感病毒的“多面手”——NS1蛋白。

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NS1:流感病毒劫持宿主、

逃避免疫的“多功能指挥官”

NS1,即非结构蛋白1(Nonstructural protein 1),是甲型流感病毒重要的多功能毒力因子。与主要承担单一酶活性或结构功能的病毒蛋白不同,NS1更像是病毒感染过程中的一个“多功能调控中心”。感染发生后,它通过与病毒RNA以及多种宿主蛋白相互作用,一方面帮助病毒完成复制,另一方面压制宿主天然免疫系统的反击。

已有研究显示,NS1能够参与干扰素拮抗、病毒mRNA剪接与核输出、蛋白亚细胞定位以及宿主细胞功能调控等多个过程。尤其重要的是,NS1能够干扰RIG-I介导的天然免疫识别,使病毒在感染早期躲避免疫系统的“雷达”。也就是说,如果把病毒感染比作一场“攻城战”,NS1不仅负责帮助病毒运输“物资”,还负责干扰宿主的“报警系统”。这也赋予NS1一个非常有吸引力的药物靶点特征:针对一个蛋白,有可能同时破坏病毒复制、病毒RNA加工以及免疫逃逸等多个环节。目前已有ML303、黄芩苷等NS1抑制剂被报道,但NS1靶向药物总体仍处于探索阶段,尚缺乏兼具体内药效、明确作用位点和多功能抑制机制的小分子。因此,围绕NS1开展原创抗流感药物发现具有重要研究价值。

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向海洋寻找新药:HDN2398从何而来?

海洋蕴藏着极其丰富的生物资源。特殊的高盐、高压、低温、寡营养以及复杂生态竞争环境,使海洋微生物形成了与陆地生物显著不同的次级代谢体系,也由此产生了大量结构新颖、活性独特的天然产物。对于创新药研发而言,这些独特的海洋天然产物不仅提供了新的“分子资源”,更有可能带来传统化学空间之外的新药骨架。

长期以来,研究团队持续围绕海洋微生物天然产物发现、活性评价以及抗病毒先导化合物研发开展研究。在本项研究中,团队首先对包含200余个化合物的海洋真菌来源化合物库进行了抗甲型流感病毒筛选,并进一步围绕海洋天然产物骨架扩展内部化合物库。经过多轮活性和毒性评价,从56个候选化合物中筛选出两个具有较好活性和较低毒性的候选分子,其中带有特定氟取代的吲哚生物碱衍生物HDN2398表现最为突出。

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图1 带有特定氟取代的吲哚生物碱衍生物体外活性评

因此,HDN2398的发现体现的并不是简单的“从海里捞出一个分子”,而是一个从“海洋天然产物资源发现—特色骨架挖掘—衍生化设计—活性筛选—先导化合物确定”逐步推进的研究过程。这也是海洋药物开发的重要价值所在:把海洋生物长期进化形成的独特化学多样性,转化为创新药物研发的“蓝色分子库”。

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从培养皿到动物:

HDN2398表现出良好的体内外抗流感活性

找到一个有活性的化合物只是第一步。它是否能够抑制不同流感病毒?是否具有足够的安全窗口?在动物体内是否仍然有效?研究团队对此进行了系统评价。

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图2 HDN2398体外和体内广谱抑制IAV

  1. 对多种甲型流感病毒具有抑制作用

细胞实验显示,HDN2398能够剂量依赖性抑制多种IAV毒株,包括不同来源的H1N1和H3N2病毒,其IC₅₀约为2.6—7.7 μM。同时,HDN2398在多种细胞中的细胞毒性较低,在MDCK细胞中的选择指数约为159.8,显示出较好的体外活性和初步安全窗口。尤其值得注意的是,HDN2398并不是通过抑制传统的HA、NA或病毒聚合酶发挥作用,这提示研究人员:它很可能命中了一个不同于现有抗流感药物的新靶点。

  1. 口服给药在小鼠模型中同样有效

研究团队进一步建立了致死性甲型流感病毒感染小鼠模型。结果显示,口服给予HDN2398后,小鼠的生存情况得到明显改善。其中,5 mg/kg/day HDN2398治疗组在感染后第14天的存活率达到90%;与此同时,HDN2398还能够减轻感染动物的体重下降,显著降低肺组织病毒滴度,并改善肺部炎症和病理损伤。在论文设定的实验条件下,HDN2398表现出了具有竞争力的抗病毒效果。从细胞水平的广谱活性到动物水平的口服保护作用,这为HDN2398进一步开展成药性研究提供了重要依据。

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找到真正的“靶心”:

HDN2398直接结合NS1蛋白

那么,HDN2398究竟在攻击流感病毒的哪个环节?不同时间加药实验首先提供了线索:HDN2398主要作用于病毒吸附后的0—6小时,但对病毒HA介导的吸附和NA活性没有明显影响,也没有直接抑制由NP和病毒聚合酶构成的minigenome系统。相反,在NS1相关的干扰素报告系统中,HDN2398能够显著逆转NS1造成的干扰素抑制。

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图3 HDN2398主要通过靶向NS1来抑制病毒复制

研究人员因此将目标锁定NS1。随后,SPR实验显示HDN2398能够剂量依赖性直接结合NS1蛋白;DARTS实验也进一步证实HDN2398能够特异性保护NS1免受蛋白酶降解,而对NA蛋白没有类似作用。这些结果共同证明:NS1是HDN2398发挥抗甲型流感病毒作用的重要直接靶蛋白。然而,研究真正有意思的部分才刚刚开始。因为HDN2398并不是简单关闭NS1的一项功能,而是像在NS1这个“病毒指挥中心”中同时切断了多条线路。

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“一药多效”:

HDN2398同时打断NS1的多条关键功能链

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图4 HDN2398影响NS1多个功能来抑制病毒

第一条:干扰NS1二聚化和dsRNA结合,解除病毒对干扰素系统的压制

NS1逃避免疫的重要手段之一,是通过结合双链RNA(dsRNA),并干扰TRIM25/RIG-I介导的病毒识别过程,使宿主不能及时启动干扰素反应。研究发现,HDN2398能够阻断NS1二聚化,并降低NS1与dsRNA的结合。与此同时,它还能够干扰NS1—TRIM25相互作用,提高RIG-I泛素化水平,进一步促进MAVS及磷酸化IRF3信号恢复。换句话说,HDN2398不是简单地“刺激免疫”,而是通过限制NS1的免疫逃逸能力,让被病毒压制的天然免疫系统重新启动。

第二条:干扰NS1—nucleolin互作,改变NS1核仁定位

NS1需要与宿主核仁蛋白 nucleolin(核仁素)相互作用,以维持其特定的核仁定位和胞内动态。HDN2398处理后,NS1与nucleolin的共定位明显减少。Co-IP和SPR等实验进一步表明,HDN2398能够剂量依赖性破坏NS1与nucleolin的结合。由此,HDN2398改变了NS1正常的亚细胞定位过程。

第三条:阻断NS1—NXF1,抑制病毒mRNA核输出

流感病毒的遗传信息要最终转化为大量病毒蛋白,其mRNA必须从细胞核运输到细胞质。研究发现,HDN2398能够显著减少病毒M1和NA等mRNA从细胞核向胞质转运。进一步实验显示,其关键机制与HDN2398破坏NS1—NXF1相互作用密切相关。病毒虽然完成了部分mRNA合成,但后续“运输链”被截断,病毒复制效率随之下降。

第四条:阻断NS1—NS1-BP,干扰病毒mRNA剪接

NS1还能够与宿主蛋白 NS1-BP相互作用,参与病毒M基因mRNA剪接。研究表明,HDN2398可减少NS1与NS1-BP结合,并显著降低M2 mRNA及M2/M mRNA比例,从而干扰流感病毒mRNA正常剪接过程。因此,HDN2398所形成的并不是传统意义上的“一个靶点对应一种酶活性”的抑制模式,而是:通过直接结合一个多功能病毒蛋白,同时切断多条“病毒—宿主”互作网络

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继续深入结合位点:

Phe9和Trp187成为关键线索

研究团队进一步通过分子对接、耐药病毒筛选、突变蛋白结合分析以及反向遗传学等方法追踪HDN2398在NS1上的关键作用区域。结果将焦点指向两个重要氨基酸——Phe9(F9)和Trp187(W187)。其中,W187位于NS1效应结构域,是NS1二聚化界面的重要组成部分。分子模拟显示,HDN2398可能占据与NS1二聚化相关的疏水口袋,从而竞争性干扰NS1分子之间的结合;而位于RNA结合结构域的F9,则可能参与HDN2398对NS1-dsRNA功能的调控。

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图5 HDN2398与NS1蛋白的关键结合位点的鉴定

更有说服力的是,当病毒NS1发生F9C或W187G突变后,HDN2398与NS1的结合和功能抑制均明显减弱,在重组病毒感染模型中,其抗病毒作用也受到显著影响。这使研究进一步建立起从:“化合物”→“NS1靶蛋白”→“功能结构域”→“关键氨基酸位点”→“细胞抗病毒作用”→“动物体内药效”的较完整证据链。研究还提示,H5N1 NS1相应区域也可能形成类似的作用模式,为进一步研究其对高致病性流感病毒的广谱潜力提供了基础。

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这项工作的创新在哪里?

创新一:发现具有体内外活性的海洋来源NS1小分子抑制剂

研究从海洋真菌来源化合物资源出发,发现了具有新化学骨架和明确NS1靶向作用的HDN2398,并从细胞到动物模型验证其抗甲型流感病毒活性,将海洋天然产物资源与抗病毒新靶点药物发现有效连接起来。

创新二:从“抑制一个功能”拓展为“同时干预NS1多功能网络”

以往NS1抑制剂更多聚焦其dsRNA结合或CPSF30相关单一功能。本研究发现,HDN2398能够同时干预“NS1二聚化、dsRNA结合、NS1—TRIM25、NS1—nucleolin、NS1—NXF1及NS1—NS1-BP”等多个过程,进而同时影响干扰素拮抗、核仁定位、病毒mRNA剪接和核输出。这种“靶向一个病毒核心调控蛋白、同步破坏多条病毒—宿主互作”的模式,为广谱抗病毒药物研发提供了新的思路。论文也据此提出,HDN2398可能作为靶向NS1—宿主互作的新型抗IAV候选分子继续开发。

创新三:建立“靶点—位点—功能—体内药效”的完整机制证据链

研究不仅回答了“HDN2398有没有抗病毒活性”,还进一步回答了“作用于谁、在哪里作用、影响什么功能以及这种作用能否在动物体内转化为疗效”。尤其是Phe9和Trp187关键位点的发现,使HDN2398研究由表型筛选深入到分子作用界面,为后续开展结构优化、构效关系研究以及基于NS1结构的药物设计提供了重要基础。

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图6 HDN2398作用机制图

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从“蓝色资源”到“蓝色药库”

浩瀚海洋不仅孕育着丰富的生物多样性,也蕴藏着巨大的化学多样性。一个真正具有潜力的海洋药物先导分子,需要经历从“资源发现、化学结构鉴定与优化,到靶点确认、药理机制解析,再到动物药效和成药性评价”的一系列过程。

HDN2398的发现,是这一研究链条的一个缩影。更重要的是,这项工作提示:面对流感病毒不断变异和耐药性挑战,创新药物研发不一定只能围绕已有靶点不断“重复优化”。从海洋特殊化学空间中寻找原创分子,再瞄准病毒尚未被充分开发的重要蛋白以及病毒—宿主互作界面,可能为抗流感药物研发开辟新的路径。

目前,HDN2398仍处于科研和候选先导化合物研究阶段。论文作者也指出,未来仍需进一步评价其对H5N1、H7N9等高致病性流感病毒的抗病毒效果,并系统开展药代动力学、安全性、制剂及成药性研究。但从海洋天然产物到NS1新靶点,从体外活性到动物保护,从蛋白结合再到关键氨基酸位点,这项研究已经为“靶向NS1的新机制抗流感药物研发”迈出了重要一步。

论文信息:

论文题目:Identifying a broad-spectrum influenza inhibitor that blocks multiple functions of viral NS1 protein

期刊:Nature Communications

作者:Yang Zhang#, Yanan Luo#, Wenrui Gai#, Jinyu Wang, Lianghao Huang, Zihan Wang, Lishan Sun, Wanting Jiao, Wei Wang* & Dehai Li*

文章链接:https://doi.org/10.1038/s41467-026-77380-9

主要研究团队简介

  • 通讯作者:

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李德海 教授

中国海洋大学医药学院教授、博士生导师,海洋药物教育部重点实验室常务副主任、医药学院副院长,教育部“新世纪优秀人才支持计划”(2012年)、“山东省自然科学杰出青年基金”(2014年)获得者、山东省“泰山学者”(2018年青年专家、2024年特聘专家)、教育部CJXZ奖励计划青年专家(2019年)。长期从事海洋天然药物化学研究,重点开展深远海及海洋共附生微生物资源挖掘、海洋微生物药物先导化合物发现与结构优化、海洋真菌次级代谢产物生物合成等研究。已在 JACS、Angewandte Chemie、Nature Communications、Chemical Science、Journal of Medicinal Chemistry 等期刊发表系列研究成果,获多项授权发明专利。

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王伟 教授

中国海洋大学医药学院教授、博士生导师。长期从事抗病毒药理学和病毒学研究,重点围绕基于新靶点的海洋抗病毒药物、重要病毒内吞与进入机制以及新型抗病毒免疫调节剂开展研究。主持多项国家自然科学基金项目,在 JACS、ACS Nano、Nucleic Acids Researc、Journal of Medicinal Chemistry、British Journal of Pharmacology 等期刊发表系列成果,并围绕抗病毒活性化合物申请和授权多项国家发明专利。


  • 第一作者:

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张洋 副教授

中国海洋大学医药学院副教授、硕士生导师。主要从事抗病毒药理学和病毒糖生物学研究,研究方向包括新型作用靶点导向的抗流感病毒药物设计与研发、病毒免疫机制与疫苗及佐剂研究、病毒—宿主糖链相互作用机制研究。在 Carbohydrate Polymers、Journal of Medicinal Chemistry、Journal of Biological Chemistry、Phytomedicine 等期刊发表系列研究成果。

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罗亚楠-中国海洋大学硕士研究生

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盖文睿-中国海洋大学博士研究生

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